Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf608Q56A10 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms