Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc185Q3V118 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms