Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp48Q3V0C5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms