Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm28047Q3US59 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm28047Q3US59 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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