Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms