Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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D13Ertd608eQ3UPR8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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D13Ertd608eQ3UPR8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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