Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpr55Q3UJF0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms