Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm648Q3UJ22 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm648Q3UJ22 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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