Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trafd1Q3UDK1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms