Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LbrQ3U9G9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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