Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 2810403D21Rik-209ENSMUST00000207966 1433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms