Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rnf40Q3U319 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rnf40Q3U319 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rnf40Q3U319 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rnf40Q3U319 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rnf40Q3U319 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rnf40Q3U319 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rnf40Q3U319 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rnf40Q3U319 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rnf40Q3U319 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Rnf40Q3U319 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf40Q3U319 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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