Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms