Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ctdnep1Q3TP92 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ctdnep1Q3TP92 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ctdnep1Q3TP92 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ctdnep1Q3TP92 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ctdnep1Q3TP92 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ctdnep1Q3TP92 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ctdnep1Q3TP92 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ctdnep1Q3TP92 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ctdnep1Q3TP92 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ctdnep1Q3TP92 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms