Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RubcnlQ3TD16 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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