Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itgb8Q0VBD0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms