Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms