Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TrioQ0KL02 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms