Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn2bQ0KL01 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms