Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cnn2Q08093 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms