Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms