Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Thbs3Q05895 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Thbs3Q05895 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Thbs3Q05895 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Thbs3Q05895 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Thbs3Q05895 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Thbs3Q05895 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Thbs3Q05895 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Thbs3Q05895 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Thbs3Q05895 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Thbs3Q05895 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Thbs3Q05895 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Thbs3Q05895 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Thbs3Q05895 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs3Q05895 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Thbs3Q05895 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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