Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms