Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms