Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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RykQ01887 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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RykQ01887 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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RykQ01887 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RykQ01887 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RykQ01887 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RykQ01887 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RykQ01887 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RykQ01887 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RykQ01887 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RykQ01887 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RykQ01887 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RykQ01887 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RykQ01887 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RykQ01887 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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RykQ01887 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RykQ01887 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RykQ01887 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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RykQ01887 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RykQ01887 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RykQ01887 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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RykQ01887 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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RykQ01887 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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RykQ01887 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RykQ01887 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RykQ01887 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RykQ01887 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RykQ01887 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RykQ01887 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RykQ01887 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RykQ01887 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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