Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd1Q01822 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms