Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms