Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4dQ01063 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms