Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rbp4Q00724 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp4Q00724 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms