Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Itga4Q00651 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Itga4Q00651 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms