Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited1P97769 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited1P97769 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms