Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Npas1P97459 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Npas1P97459 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Npas1P97459 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Npas1P97459 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Npas1P97459 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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