Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms