Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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