Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tubg1P83887 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms