Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms