Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Otx2P80206 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms