Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp5bP56480 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp5bP56480 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms