Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Irf5P56477 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irf5P56477 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf5P56477 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf5P56477 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irf5P56477 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Irf5P56477 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms