Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcd3P55096 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms