Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Fgf9P54130 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms