Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Apobec1P51908 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec1P51908 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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