Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TspoP50637 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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