Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SftpbP50405 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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SftpbP50405 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SftpbP50405 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SftpbP50405 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SftpbP50405 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SftpbP50405 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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SftpbP50405 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SftpbP50405 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SftpbP50405 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SftpbP50405 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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