Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SftpdP50404 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms