Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rplp1P47955 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rplp1P47955 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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