Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SrprbP47758 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrprbP47758 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SrprbP47758 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SrprbP47758 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SrprbP47758 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SrprbP47758 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SrprbP47758 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SrprbP47758 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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