Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtgfrP43117 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms