Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VhlP40338 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VhlP40338 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VhlP40338 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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