Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf1P39428 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf1P39428 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf1P39428 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf1P39428 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf1P39428 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf1P39428 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf1P39428 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf1P39428 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf1P39428 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf1P39428 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf1P39428 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf1P39428 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Traf1P39428 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Traf1P39428 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Traf1P39428 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Traf1P39428 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Traf1P39428 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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